L’incidence est toutefois en régression constante, le pays ayant comptabilisé 41% de nouveaux cas entre 2000 et 2015, soit une baisse de la mortalité de l’ordre de 68%.

Selon le PNLP la région sahélienne du Nord, avec un taux de morbidité de 29,3%, constitue la zone la plus touchée par le paludisme, le Nord-Ouest méridional, avec 13,06% enregistrant le taux le plus bas en la matière.

Depuis 2005, l'administration du traitement préventif intermittent (TPI) contre le paludisme est gratuite à partir du 4ème mois de grossesse, la même règle étant applicable depuis janvier 2011 dans le traitement du paludisme simple pour les enfants de moins de 5 ans.

Dans la même veine, depuis 2011, les pouvoirs publics organisent régulièrement de campagnes nationales de distribution gratuite de moustiquaires imprégnées d'insecticide à longue durée d'action (MILDA) pour une couverture de 70%, mais avec 56% de taux d’utilisation, selon les estimations du PNLP.